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The genetic basis of Lewy body dementia (LBD) is not well understood. Here, we performed whole-genome sequencing in large cohorts of LBD cases and neurologically healthy controls to study the genetic architecture of this understudied form of dementia, and to generate a resource for the scientific community. Genome-wide association analysis identified five independent risk loci, whereas genome-wide gene-aggregation tests implicated mutations in the gene GBA. Genetic risk scores demonstrate that LBD shares risk profiles and pathways with Alzheimer’s disease and Parkinson’s disease, providing a deeper molecular understanding of the complex genetic architecture of this age-related neurodegenerative condition.
Chia, R., Sabir, M. S., Bandres-Ciga, S., Saez-Atienzar, S., Reynolds, R. H., Gustavsson, E., Walton, R. L., Ahmed, S., Viollet, C., Ding, J., Makarious, M. B., Diez-Fairen, M., Portley, M. K., Shah, Z., Abramzon, Y., Hernandez, D. G., Blauwendraat, C., Stone, D. J., Eicher, J., Parkkinen, L., Ansorge, O., Clark, L., Honig, L. S., Marder, K., Lemstra, A., St George-Hyslop, P., Londos, E., Morgan, K., Lashley, T., Warner, T. T., Jaunmuktane, Z., Galasko, D., Santana, I., Tienari, P. J., Myllykangas, L., Oinas, M., Cairns, N. J., Morris, J. C., Halliday, G. M., Van Deerlin, V. M., Trojanowski, J. Q., Grassano, M., Calvo, A., Mora, G., Canosa, A., Floris, G., Bohannan, R. C., Brett, F., Gan-Or, Z., Geiger, J. T., Moore, A., May, P., Krüger, R., Goldstein, D. S., Lopez, G., Tayebi, N., Sidransky, E., Norcliffe-Kaufmann, L., Palma, J., Kaufmann, H., Shakkottai, V. G., Perkins, M., Newell, K. L., Gasser, T., Schulte, C., Landi, F., Salvi, E., Cusi, D., Masliah, E., Kim, R. C., Caraway, C. A., Monuki, E. S., Brunetti, M., Dawson, T. M., Rosenthal, L. S., Albert, M. S., Pletnikova, O., Troncoso, J. C., Flanagan, M. E., Mao, Q., Bigio, E. H., Rodríguez-Rodríguez, E., Infante, J., Lage, C., González-Aramburu, I., Sanchez-Juan, P., Ghetti, B., Keith, J., Black, S. E., Masellis, M., Rogaeva, E., Duyckaerts, C., Brice, A., Lesage, S., Xiromerisiou, G., Barrett, M. J., Tilley, B. S., Gentleman, S., Logroscino, G., Serrano, G. E., Beach, T. G., Mckeith, I. G., Thomas, A. J., Attems, J., Morris, C. M., Palmer, L., Love, S., Troakes, C., Al-Sarraj, S., Hodges, A. K., Aarsland, D., Klein, G., Kaiser, S. M., Woltjer, R., Pastor, P., Bekris, L. M., Leverenz, J. B., Besser, L. M., Kuzma, A., Renton, A. E., Goate, A., Bennett, D. A., Scherzer, C. R., Morris, H. R., Ferrari, R., Albani, D., Pickering-Brown, S., Faber, K., Kukull, W. A., Morenas-Rodriguez, E., Lleó, A., Fortea, J., Alcolea, D., Clarimon, J., Nalls, M. A., Ferrucci, L., Resnick, S. M., Tanaka, T., Foroud, T. M., Graff-Radford, N. R., Wszolek, Z. K., Ferman, T., Boeve, B. F., Hardy, J. A., Topol, E. J., Torkamani, A., Singleton, A. B., Ryten, M., Dickson, D. W., Chiò, A., Ross, O. A., Gibbs, J. R., Dalgard, C. L., Traynor, B. J., Scholz, S. W., Genome sequencing analysis identifies new loci associated with Lewy body dementia and provides insights into its genetic architecture, <<NATURE GENETICS>>, 2021; 53 (3): 294-303. [doi:10.1038/s41588-021-00785-3] [https://hdl.handle.net/10807/302084]
Genome sequencing analysis identifies new loci associated with Lewy body dementia and provides insights into its genetic architecture
Chia, Ruth;Sabir, Marya S;Bandres-Ciga, Sara;Saez-Atienzar, Sara;Reynolds, Regina H;Gustavsson, Emil;Walton, Ronald L;Ahmed, Sarah;Viollet, Coralie;Ding, Jinhui;Makarious, Mary B;Diez-Fairen, Monica;Portley, Makayla K;Shah, Zalak;Abramzon, Yevgeniya;Hernandez, Dena G;Blauwendraat, Cornelis;Stone, David J;Eicher, John;Parkkinen, Laura;Ansorge, Olaf;Clark, Lorraine;Honig, Lawrence S;Marder, Karen;Lemstra, Afina;St George-Hyslop, Peter;Londos, Elisabet;Morgan, Kevin;Lashley, Tammaryn;Warner, Thomas T;Jaunmuktane, Zane;Galasko, Douglas;Santana, Isabel;Tienari, Pentti J;Myllykangas, Liisa;Oinas, Minna;Cairns, Nigel J;Morris, John C;Halliday, Glenda M;Van Deerlin, Vivianna M;Trojanowski, John Q;Grassano, Maurizio;Calvo, Andrea;Mora, Gabriele;Canosa, Antonio;Floris, Gianluca;Bohannan, Ryan C;Brett, Francesca;Gan-Or, Ziv;Geiger, Joshua T;Moore, Anni;May, Patrick;Krüger, Rejko;Goldstein, David S;Lopez, Grisel;Tayebi, Nahid;Sidransky, Ellen;Norcliffe-Kaufmann, Lucy;Palma, Jose-Alberto;Kaufmann, Horacio;Shakkottai, Vikram G;Perkins, Matthew;Newell, Kathy L;Gasser, Thomas;Schulte, Claudia;Landi, Francesco;Salvi, Erika;Cusi, Daniele;Masliah, Eliezer;Kim, Ronald C;Caraway, Chad A;Monuki, Edwin S;Brunetti, Maura;Dawson, Ted M;Rosenthal, Liana S;Albert, Marilyn S;Pletnikova, Olga;Troncoso, Juan C;Flanagan, Margaret E;Mao, Qinwen;Bigio, Eileen H;Rodríguez-Rodríguez, Eloy;Infante, Jon;Lage, Carmen;González-Aramburu, Isabel;Sanchez-Juan, Pascual;Ghetti, Bernardino;Keith, Julia;Black, Sandra E;Masellis, Mario;Rogaeva, Ekaterina;Duyckaerts, Charles;Brice, Alexis;Lesage, Suzanne;Xiromerisiou, Georgia;Barrett, Matthew J;Tilley, Bension S;Gentleman, Steve;Logroscino, Giancarlo;Serrano, Geidy E;Beach, Thomas G;McKeith, Ian G;Thomas, Alan J;Attems, Johannes;Morris, Christopher M;Palmer, Laura;Love, Seth;Troakes, Claire;Al-Sarraj, Safa;Hodges, Angela K;Aarsland, Dag;Klein, Gregory;Kaiser, Scott M;Woltjer, Randy;Pastor, Pau;Bekris, Lynn M;Leverenz, James B;Besser, Lilah M;Kuzma, Amanda;Renton, Alan E;Goate, Alison;Bennett, David A;Scherzer, Clemens R;Morris, Huw R;Ferrari, Raffaele;Albani, Diego;Pickering-Brown, Stuart;Faber, Kelley;Kukull, Walter A;Morenas-Rodriguez, Estrella;Lleó, Alberto;Fortea, Juan;Alcolea, Daniel;Clarimon, Jordi;Nalls, Mike A;Ferrucci, Luigi;Resnick, Susan M;Tanaka, Toshiko;Foroud, Tatiana M;Graff-Radford, Neill R;Wszolek, Zbigniew K;Ferman, Tanis;Boeve, Bradley F;Hardy, John A;Topol, Eric J;Torkamani, Ali;Singleton, Andrew B;Ryten, Mina;Dickson, Dennis W;Chiò, Adriano;Ross, Owen A;Gibbs, J Raphael;Dalgard, Clifton L;Traynor, Bryan J;Scholz, Sonja W
2021
Abstract
The genetic basis of Lewy body dementia (LBD) is not well understood. Here, we performed whole-genome sequencing in large cohorts of LBD cases and neurologically healthy controls to study the genetic architecture of this understudied form of dementia, and to generate a resource for the scientific community. Genome-wide association analysis identified five independent risk loci, whereas genome-wide gene-aggregation tests implicated mutations in the gene GBA. Genetic risk scores demonstrate that LBD shares risk profiles and pathways with Alzheimer’s disease and Parkinson’s disease, providing a deeper molecular understanding of the complex genetic architecture of this age-related neurodegenerative condition.
Chia, R., Sabir, M. S., Bandres-Ciga, S., Saez-Atienzar, S., Reynolds, R. H., Gustavsson, E., Walton, R. L., Ahmed, S., Viollet, C., Ding, J., Makarious, M. B., Diez-Fairen, M., Portley, M. K., Shah, Z., Abramzon, Y., Hernandez, D. G., Blauwendraat, C., Stone, D. J., Eicher, J., Parkkinen, L., Ansorge, O., Clark, L., Honig, L. S., Marder, K., Lemstra, A., St George-Hyslop, P., Londos, E., Morgan, K., Lashley, T., Warner, T. T., Jaunmuktane, Z., Galasko, D., Santana, I., Tienari, P. J., Myllykangas, L., Oinas, M., Cairns, N. J., Morris, J. C., Halliday, G. M., Van Deerlin, V. M., Trojanowski, J. Q., Grassano, M., Calvo, A., Mora, G., Canosa, A., Floris, G., Bohannan, R. C., Brett, F., Gan-Or, Z., Geiger, J. T., Moore, A., May, P., Krüger, R., Goldstein, D. S., Lopez, G., Tayebi, N., Sidransky, E., Norcliffe-Kaufmann, L., Palma, J., Kaufmann, H., Shakkottai, V. G., Perkins, M., Newell, K. L., Gasser, T., Schulte, C., Landi, F., Salvi, E., Cusi, D., Masliah, E., Kim, R. C., Caraway, C. A., Monuki, E. S., Brunetti, M., Dawson, T. M., Rosenthal, L. S., Albert, M. S., Pletnikova, O., Troncoso, J. C., Flanagan, M. E., Mao, Q., Bigio, E. H., Rodríguez-Rodríguez, E., Infante, J., Lage, C., González-Aramburu, I., Sanchez-Juan, P., Ghetti, B., Keith, J., Black, S. E., Masellis, M., Rogaeva, E., Duyckaerts, C., Brice, A., Lesage, S., Xiromerisiou, G., Barrett, M. J., Tilley, B. S., Gentleman, S., Logroscino, G., Serrano, G. E., Beach, T. G., Mckeith, I. G., Thomas, A. J., Attems, J., Morris, C. M., Palmer, L., Love, S., Troakes, C., Al-Sarraj, S., Hodges, A. K., Aarsland, D., Klein, G., Kaiser, S. M., Woltjer, R., Pastor, P., Bekris, L. M., Leverenz, J. B., Besser, L. M., Kuzma, A., Renton, A. E., Goate, A., Bennett, D. A., Scherzer, C. R., Morris, H. R., Ferrari, R., Albani, D., Pickering-Brown, S., Faber, K., Kukull, W. A., Morenas-Rodriguez, E., Lleó, A., Fortea, J., Alcolea, D., Clarimon, J., Nalls, M. A., Ferrucci, L., Resnick, S. M., Tanaka, T., Foroud, T. M., Graff-Radford, N. R., Wszolek, Z. K., Ferman, T., Boeve, B. F., Hardy, J. A., Topol, E. J., Torkamani, A., Singleton, A. B., Ryten, M., Dickson, D. W., Chiò, A., Ross, O. A., Gibbs, J. R., Dalgard, C. L., Traynor, B. J., Scholz, S. W., Genome sequencing analysis identifies new loci associated with Lewy body dementia and provides insights into its genetic architecture, <<NATURE GENETICS>>, 2021; 53 (3): 294-303. [doi:10.1038/s41588-021-00785-3] [https://hdl.handle.net/10807/302084]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
