Colli, Licia
Colli, Licia
PIACENZA - Dipartimento di Scienze animali, della nutrizione e degli alimenti (DIANA)
Mitogenome information in cattle breeding and conservation genetics: Developments and possibilities of the SNP chip
2023 Brajkovic, V.; Hršak, D.; Bradić, L.; Turkalj, K.; Novosel, D.; Ristov, S.; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia; Cubric-Curik, V.; Sölkner, J.; Curik, I.
Geographical contrasts of Y-chromosomal haplogroups from wild and domestic goats reveal ancient migrations and recent introgressions
2022 Nijman, I. J.; Rosen, B. D.; Bardou, P.; Faraut, T.; Cumer, T.; Daly, K. G.; Zheng, Z.; Cai, Y.; Asadollahpour, H.; Kul, B. C.; Zhang, W. -Y.; Guangxin, E.; Ayin, A.; Baird, H.; Bakhtin, M.; Balteanu, V. A.; Barfield, D.; Berger, B.; Blichfeldt, T.; Boink, G.; Bugiwati, S. R. A.; Cai, Z.; Carolan, S.; Clark, E.; Cubric-Curik, V.; Dagong, M. I. A.; Dorji, T.; Drew, L.; Guo, J.; Hallsson, J.; Horvat, S.; Kantanen, J.; Kawaguchi, F.; Kazymbet, P.; Khayatzadeh, N.; Kim, N.; Shah, M. K.; Liao, Y.; Martinez, A.; Masangkay, J.; Masaoka, M.; Mazza, Raffaele; Mcewan, J.; Milanesi, Marco; Omar, F. M.; Nomura, Y.; Ouchene-Khelifi, N. -A.; Pereira, F.; Sahana, G.; Salavati, M.; Sasazaki, S.; Da Silva, A.; Simcic, M.; Solkner, J.; Sutherland, A.; Tigchelaar, J.; Zhang, H.; Ajmone Marsan, Paolo; Bradley, D. G.; Colli, Licia; Drogemuller, C.; Jiang, Y.; Lei, C.; Mannen, H.; Pompanon, F.; Tosser-Klopp, G.; Lenstra, J. A.; Kijas, J.; Guldbrandtsen, B.; Denoyelle, L.; Sarry, J.; le Talouarn, E.; Alberti, A.; Orvain, C.; Engelen, S.; Duby, D.; Martin, P.; Danchin, C.; Duclos, D.; Allain, D.; Arquet, R.; Mandonnet, N.; Naves, M.; Palhiere, I.; Rupp, R.; Pompanon, F.; Rezaei, H. R.; Foran, M.; Stella, A.; Del Corvo, Marcello; Crisa, A.; Marletta, D.; Crepaldi, P.; Ottino, M.; Randi, E.; Mujibi, D. F.; Gondwe, T.; Benjelloun, B.; Taela, M. D. G.; Nash, O.; Moaeen-ud-Din, M.; Visser, C.; Goyache, F.; Alvarez, I.; Amills, M.; Sanchez, A.; Capote, J.; Jordana, J.; Pons, A.; Balears, I.; Molina, A.; Mruttu, H. A.; Masiga, C. W.; Van Tassell, C. P.; Reecy, J.; Luikart, G.; Sikosana, J.; Anila, H.; Petrit, D.; Roswitha, B.; Philippe, B.; Aziz, F.; Christos, P.; El-Barody, M. A. A.; Pierre, T.; Phillip, E.; Gordon, L.; Albano, B. -P.; Stephanie, Z.; Michel, T.; Georg, E.; Horst, B.; Eveline, I. -A.; Luhken, G.; Krugmann, D.; Eva-Maria, P.; Shirin, L.; Katja, G.; Christina, P.; Jutta, R.; Marco, B.; Andreas, G.; Al Tarrayrah, J.; Georgios, K.; Olga, K.; Katerina, K.; Christina, L.; Anton, I.; Lazlo, F.; Gabriele, C.; Elisabetta, M.; Marco, P.; Antonello, C.; Tiziana, S.; Mario, C.; Francesca, F.; Stefano, G.; Marta, M.; Bordonaro, S.; Giuseppe, D. U.; Fabio, P.; Mariasilvia, D. A.; Alessio, V.; Irene, C.; Lorraine, P.; Mahamoud, A. -S.; Van Cann, L. M.; Roman, N.; Popielarczyk, D.; Ewa, S.; Augustin, V.; Susana, D.; Javier, C.; Oscar, C.; David, G.; Regis, C.; Gabriela, O. -R.; Glowatzki, M. -L.; Okan, E.; Inci, T.; Evren, K.; Mike, B.; Trinidad, P.; Gabriela, J.; Godfrey, H.; Stella, D.; Louise, W.; Martin, T.; Sam, J.; Riccardo, S.
Identification of genomic regions associated with total and progressive sperm motility in Italian Holstein bulls
2022 Ramirez-Diaz, J; Cenadelli, S; Bornaghi, V; Bongioni, G; Montedoro, S M; Achilli, A; Capelli, C; Rincon, J C; Milanesi, M; Passamonti, Matilde Maria; Colli, Licia; Barbato, Mario; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo
Nutrigenomics: an underestimated contribution to the functional role of polyphenols
2022 Dall'Asta, Margherita; Barbato, Mario; Rocchetti, Gabriele; Rossi, Filippo; Lucini, Luigi; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia
The SNP-Based Profiling of Montecristo Feral Goat Populations Reveals a History of Isolation, Bottlenecks, and the Effects of Management
2022 Somenzi, Elisa; Senczuk, G.; Ciampolini, R.; Cortellari, M.; Vajana, Elia; Tosser-Klopp, G.; Pilla, F.; Ajmone Marsan, Paolo; Crepaldi, P.; Colli, Licia
Water Buffalo Genomic Diversity
2022 Colli, Licia; Williams, John Lewis; Williams, J. L.; Ajmone-Marsan, P.
What Can Genetics Do for the Control of Infectious Diseases in Aquaculture?
2022 Sciuto, S.; Colli, Licia; Fabris, A.; Pastorino, P.; Stoppani, N.; Esposito, G.; Prearo, M.; Esposito, G.; Ajmone Marsan, Paolo; Acutis, P. L.; Colussi, S.
Author Correction: The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data (Scientific Reports, (2021), 11, 1, (10986), 10.1038/s41598-021-89900-2)
2021 Cortellari, M.; Barbato, M.; Talenti, A.; Bionda, A.; Carta, A.; Ciampolini, R.; Ciani, E.; Crisà, A.; Frattini, S.; Lasagna, E.; Marletta, D.; Mastrangelo, S.; Negro, A.; Randi, E.; Sarti, F. M.; Sartore, S.; Soglia, D.; Liotta, L.; Stella, A.; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, F.; Colli, Licia; Crepaldi, P.
Epigenetic Variability Among Saffron Crocus (Crocus sativus L.) Accessions Characterized by Different Phenotypes
2021 Busconi, Matteo; Wischnitzki, Elisabeth; Del Corvo, Marcello; Colli, Licia; Soffritti, Giovanna; Stagnati, Lorenzo; Fluch, Silvia; Maria Sehr, Eva; de los Mozos Pascual, Marcelino; Antonio Fernandez, José
Genome-wide diversity of Pagliarola sheep residual population and its conservation implication
2021 Persichilli, C.; Senczuk, G.; Pasqualino, L.; Anzalone, D. A.; Negrini, Riccardo; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia; Pilla, F.; Mastrangelo, S.
On the origin and diversification of Podolian cattle breeds: testing scenarios of European colonization using genome-wide SNP data
2021 Senczuk, G.; Mastrangelo, S.; Ajmone Marsan, Paolo; Becskei, Z.; Colangelo, P.; Colli, Licia; Ferretti, L.; Karsli, T.; Lancioni, H.; Lasagna, E.; Marletta, D.; Persichilli, C.; Portolano, B.; Sarti, F. M.; Ciani, E.; Pilla, F.
Runs of homozygosity in the Italian goat breeds: impact of management practices in low-input systems
2021 Cortellari, M.; Bionda, A.; Negro, A.; Frattini, S.; Mastrangelo, S.; Somenzi, Elisa; Lasagna, E.; Sarti, F. M.; Ciani, E.; Ciampolini, R.; Marletta, D.; Liotta, L.; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, F.; Colli, Licia; Talenti, A.; Crepaldi, P.
The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data
2021 Cortellari, Matteo; Barbato, Mario; Talenti, Andrea; Bionda, Arianna; Carta, Antonello; Ciampolini, Roberta; Ciani, Elena; Crisà, Alessandra; Frattini, Stefano; Lasagna, Emiliano; Marletta, Donata; Mastrangelo, Salvatore; Negro, Alessio; Randi, Ettore; Sarti, Francesca M.; Sartore, Stefano; Soglia, Dominga; Liotta, Luigi; Stella, Alessandra; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, Fabio; Colli, Licia; Crepaldi, Paola
The distribution of runs of homozygosity in the genome of river and swamp buffaloes reveals a history of adaptation, migration and crossbred events
2021 Macciotta, N. P. P.; Colli, L.; Cesarani, A.; Ajmone Marsan, P.; Low, W. Y.; Tearle, R.; Williams, J. L.
The quest for genes involved in adaptation to climate change in ruminant livestock
2021 Passamonti, Matilde Maria; Somenzi, Elisa; Barbato, Mario; Chillemi, G.; Colli, Licia; Joost, S.; Milanesi, Marco; Negrini, Riccardo; Santini, M.; Vajana, E.; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo
VarGoats project: a dataset of 1159 whole-genome sequences to dissect Capra hircus global diversity
2021 Denoyelle, L.; Talouarn, E.; Bardou, P.; Colli, Licia; Alberti, A.; Danchin, C.; Del Corvo, Marcello; Engelen, S.; Orvain, C.; Palhiere, I.; Rupp, R.; Sarry, J.; Salavati, M.; Amills, M.; Clark, E.; Crepaldi, P.; Faraut, T.; Masiga, C. W.; Pompanon, F.; Rosen, B. D.; Stella, A.; Van Tassell, C. P.; Tosser-Klopp, G.
A genetically unique Chinese cattle population shows evidence of common ancestry with wild species when analysed with a reduced ascertainment bias SNP panel
2020 Barbato, Mario; Reichel, M. P.; Passamonti, Matilde Maria; Low, W. Y.; Colli, Licia; Tearle, R.; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo
Adaptive introgression from indicine cattle into white cattle breeds from Central Italy
2020 Barbato, Mario; Hailer, Frank; Upadhyay, Maulik; Del Corvo, Marcello; Colli, Licia; Negrini, Riccardo; Kim, Eui-Soo; Crooijmans, Richard P. M. A.; Sonstegard, Tad; Ajmone Marsan, Paolo
Asian water buffalo: domestication, history and genetics
2020 Zhang, Y.; Colli, Licia; Barker, J. S. F.
On the origin of European sheep as revealed by the diversity of the Balkan breeds and by optimizing population-genetic analysis tools
2020 Ciani, E.; Mastrangelo, S.; Da Silva, A.; Marroni, F.; Ferencakovic, M.; Ajmone Marsan, Paolo; Baird, H.; Barbato, Mario; Colli, Licia; Delvento, C.; Dovenski, T.; Gorjanc, G.; Hall, S. J. G.; Hoda, A.; Li, M. -H.; Markovic, B.; Mcewan, J.; Moradi, M. H.; Ruiz-Larranaga, O.; Ruzic-Muslic, D.; Salamon, D.; Simcic, M.; Stepanek, O.; Curik, I.; Cubric-Curik, V.; Lenstra, J. A.
Data di pubblicazione | Titolo | Autore(i) | File |
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1-gen-2023 | Mitogenome information in cattle breeding and conservation genetics: Developments and possibilities of the SNP chip | Brajkovic, V.; Hršak, D.; Bradić, L.; Turkalj, K.; Novosel, D.; Ristov, S.; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia; Cubric-Curik, V.; Sölkner, J.; Curik, I. | |
1-gen-2022 | Geographical contrasts of Y-chromosomal haplogroups from wild and domestic goats reveal ancient migrations and recent introgressions | Nijman, I. J.; Rosen, B. D.; Bardou, P.; Faraut, T.; Cumer, T.; Daly, K. G.; Zheng, Z.; Cai, Y.; Asadollahpour, H.; Kul, B. C.; Zhang, W. -Y.; Guangxin, E.; Ayin, A.; Baird, H.; Bakhtin, M.; Balteanu, V. A.; Barfield, D.; Berger, B.; Blichfeldt, T.; Boink, G.; Bugiwati, S. R. A.; Cai, Z.; Carolan, S.; Clark, E.; Cubric-Curik, V.; Dagong, M. I. A.; Dorji, T.; Drew, L.; Guo, J.; Hallsson, J.; Horvat, S.; Kantanen, J.; Kawaguchi, F.; Kazymbet, P.; Khayatzadeh, N.; Kim, N.; Shah, M. K.; Liao, Y.; Martinez, A.; Masangkay, J.; Masaoka, M.; Mazza, Raffaele; Mcewan, J.; Milanesi, Marco; Omar, F. M.; Nomura, Y.; Ouchene-Khelifi, N. -A.; Pereira, F.; Sahana, G.; Salavati, M.; Sasazaki, S.; Da Silva, A.; Simcic, M.; Solkner, J.; Sutherland, A.; Tigchelaar, J.; Zhang, H.; Ajmone Marsan, Paolo; Bradley, D. G.; Colli, Licia; Drogemuller, C.; Jiang, Y.; Lei, C.; Mannen, H.; Pompanon, F.; Tosser-Klopp, G.; Lenstra, J. A.; Kijas, J.; Guldbrandtsen, B.; Denoyelle, L.; Sarry, J.; le Talouarn, E.; Alberti, A.; Orvain, C.; Engelen, S.; Duby, D.; Martin, P.; Danchin, C.; Duclos, D.; Allain, D.; Arquet, R.; Mandonnet, N.; Naves, M.; Palhiere, I.; Rupp, R.; Pompanon, F.; Rezaei, H. R.; Foran, M.; Stella, A.; Del Corvo, Marcello; Crisa, A.; Marletta, D.; Crepaldi, P.; Ottino, M.; Randi, E.; Mujibi, D. F.; Gondwe, T.; Benjelloun, B.; Taela, M. D. G.; Nash, O.; Moaeen-ud-Din, M.; Visser, C.; Goyache, F.; Alvarez, I.; Amills, M.; Sanchez, A.; Capote, J.; Jordana, J.; Pons, A.; Balears, I.; Molina, A.; Mruttu, H. A.; Masiga, C. W.; Van Tassell, C. P.; Reecy, J.; Luikart, G.; Sikosana, J.; Anila, H.; Petrit, D.; Roswitha, B.; Philippe, B.; Aziz, F.; Christos, P.; El-Barody, M. A. A.; Pierre, T.; Phillip, E.; Gordon, L.; Albano, B. -P.; Stephanie, Z.; Michel, T.; Georg, E.; Horst, B.; Eveline, I. -A.; Luhken, G.; Krugmann, D.; Eva-Maria, P.; Shirin, L.; Katja, G.; Christina, P.; Jutta, R.; Marco, B.; Andreas, G.; Al Tarrayrah, J.; Georgios, K.; Olga, K.; Katerina, K.; Christina, L.; Anton, I.; Lazlo, F.; Gabriele, C.; Elisabetta, M.; Marco, P.; Antonello, C.; Tiziana, S.; Mario, C.; Francesca, F.; Stefano, G.; Marta, M.; Bordonaro, S.; Giuseppe, D. U.; Fabio, P.; Mariasilvia, D. A.; Alessio, V.; Irene, C.; Lorraine, P.; Mahamoud, A. -S.; Van Cann, L. M.; Roman, N.; Popielarczyk, D.; Ewa, S.; Augustin, V.; Susana, D.; Javier, C.; Oscar, C.; David, G.; Regis, C.; Gabriela, O. -R.; Glowatzki, M. -L.; Okan, E.; Inci, T.; Evren, K.; Mike, B.; Trinidad, P.; Gabriela, J.; Godfrey, H.; Stella, D.; Louise, W.; Martin, T.; Sam, J.; Riccardo, S. | |
1-gen-2022 | Identification of genomic regions associated with total and progressive sperm motility in Italian Holstein bulls | Ramirez-Diaz, J; Cenadelli, S; Bornaghi, V; Bongioni, G; Montedoro, S M; Achilli, A; Capelli, C; Rincon, J C; Milanesi, M; Passamonti, Matilde Maria; Colli, Licia; Barbato, Mario; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo | |
1-gen-2022 | Nutrigenomics: an underestimated contribution to the functional role of polyphenols | Dall'Asta, Margherita; Barbato, Mario; Rocchetti, Gabriele; Rossi, Filippo; Lucini, Luigi; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia | |
1-gen-2022 | The SNP-Based Profiling of Montecristo Feral Goat Populations Reveals a History of Isolation, Bottlenecks, and the Effects of Management | Somenzi, Elisa; Senczuk, G.; Ciampolini, R.; Cortellari, M.; Vajana, Elia; Tosser-Klopp, G.; Pilla, F.; Ajmone Marsan, Paolo; Crepaldi, P.; Colli, Licia | |
1-gen-2022 | Water Buffalo Genomic Diversity | Colli, Licia; Williams, John Lewis; Williams, J. L.; Ajmone-Marsan, P. | |
1-gen-2022 | What Can Genetics Do for the Control of Infectious Diseases in Aquaculture? | Sciuto, S.; Colli, Licia; Fabris, A.; Pastorino, P.; Stoppani, N.; Esposito, G.; Prearo, M.; Esposito, G.; Ajmone Marsan, Paolo; Acutis, P. L.; Colussi, S. | |
1-gen-2021 | Author Correction: The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data (Scientific Reports, (2021), 11, 1, (10986), 10.1038/s41598-021-89900-2) | Cortellari, M.; Barbato, M.; Talenti, A.; Bionda, A.; Carta, A.; Ciampolini, R.; Ciani, E.; Crisà, A.; Frattini, S.; Lasagna, E.; Marletta, D.; Mastrangelo, S.; Negro, A.; Randi, E.; Sarti, F. M.; Sartore, S.; Soglia, D.; Liotta, L.; Stella, A.; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, F.; Colli, Licia; Crepaldi, P. | |
1-gen-2021 | Epigenetic Variability Among Saffron Crocus (Crocus sativus L.) Accessions Characterized by Different Phenotypes | Busconi, Matteo; Wischnitzki, Elisabeth; Del Corvo, Marcello; Colli, Licia; Soffritti, Giovanna; Stagnati, Lorenzo; Fluch, Silvia; Maria Sehr, Eva; de los Mozos Pascual, Marcelino; Antonio Fernandez, José | |
1-gen-2021 | Genome-wide diversity of Pagliarola sheep residual population and its conservation implication | Persichilli, C.; Senczuk, G.; Pasqualino, L.; Anzalone, D. A.; Negrini, Riccardo; Ajmone Marsan, Paolo; Colli, Licia; Pilla, F.; Mastrangelo, S. | |
1-gen-2021 | On the origin and diversification of Podolian cattle breeds: testing scenarios of European colonization using genome-wide SNP data | Senczuk, G.; Mastrangelo, S.; Ajmone Marsan, Paolo; Becskei, Z.; Colangelo, P.; Colli, Licia; Ferretti, L.; Karsli, T.; Lancioni, H.; Lasagna, E.; Marletta, D.; Persichilli, C.; Portolano, B.; Sarti, F. M.; Ciani, E.; Pilla, F. | |
1-gen-2021 | Runs of homozygosity in the Italian goat breeds: impact of management practices in low-input systems | Cortellari, M.; Bionda, A.; Negro, A.; Frattini, S.; Mastrangelo, S.; Somenzi, Elisa; Lasagna, E.; Sarti, F. M.; Ciani, E.; Ciampolini, R.; Marletta, D.; Liotta, L.; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, F.; Colli, Licia; Talenti, A.; Crepaldi, P. | |
1-gen-2021 | The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data | Cortellari, Matteo; Barbato, Mario; Talenti, Andrea; Bionda, Arianna; Carta, Antonello; Ciampolini, Roberta; Ciani, Elena; Crisà, Alessandra; Frattini, Stefano; Lasagna, Emiliano; Marletta, Donata; Mastrangelo, Salvatore; Negro, Alessio; Randi, Ettore; Sarti, Francesca M.; Sartore, Stefano; Soglia, Dominga; Liotta, Luigi; Stella, Alessandra; Ajmone Marsan, Paolo; Pilla, Fabio; Colli, Licia; Crepaldi, Paola | |
1-gen-2021 | The distribution of runs of homozygosity in the genome of river and swamp buffaloes reveals a history of adaptation, migration and crossbred events | Macciotta, N. P. P.; Colli, L.; Cesarani, A.; Ajmone Marsan, P.; Low, W. Y.; Tearle, R.; Williams, J. L. | |
1-gen-2021 | The quest for genes involved in adaptation to climate change in ruminant livestock | Passamonti, Matilde Maria; Somenzi, Elisa; Barbato, Mario; Chillemi, G.; Colli, Licia; Joost, S.; Milanesi, Marco; Negrini, Riccardo; Santini, M.; Vajana, E.; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo | |
1-gen-2021 | VarGoats project: a dataset of 1159 whole-genome sequences to dissect Capra hircus global diversity | Denoyelle, L.; Talouarn, E.; Bardou, P.; Colli, Licia; Alberti, A.; Danchin, C.; Del Corvo, Marcello; Engelen, S.; Orvain, C.; Palhiere, I.; Rupp, R.; Sarry, J.; Salavati, M.; Amills, M.; Clark, E.; Crepaldi, P.; Faraut, T.; Masiga, C. W.; Pompanon, F.; Rosen, B. D.; Stella, A.; Van Tassell, C. P.; Tosser-Klopp, G. | |
1-gen-2020 | A genetically unique Chinese cattle population shows evidence of common ancestry with wild species when analysed with a reduced ascertainment bias SNP panel | Barbato, Mario; Reichel, M. P.; Passamonti, Matilde Maria; Low, W. Y.; Colli, Licia; Tearle, R.; Williams, John Lewis; Ajmone Marsan, Paolo | |
1-gen-2020 | Adaptive introgression from indicine cattle into white cattle breeds from Central Italy | Barbato, Mario; Hailer, Frank; Upadhyay, Maulik; Del Corvo, Marcello; Colli, Licia; Negrini, Riccardo; Kim, Eui-Soo; Crooijmans, Richard P. M. A.; Sonstegard, Tad; Ajmone Marsan, Paolo | |
1-gen-2020 | Asian water buffalo: domestication, history and genetics | Zhang, Y.; Colli, Licia; Barker, J. S. F. | |
1-gen-2020 | On the origin of European sheep as revealed by the diversity of the Balkan breeds and by optimizing population-genetic analysis tools | Ciani, E.; Mastrangelo, S.; Da Silva, A.; Marroni, F.; Ferencakovic, M.; Ajmone Marsan, Paolo; Baird, H.; Barbato, Mario; Colli, Licia; Delvento, C.; Dovenski, T.; Gorjanc, G.; Hall, S. J. G.; Hoda, A.; Li, M. -H.; Markovic, B.; Mcewan, J.; Moradi, M. H.; Ruiz-Larranaga, O.; Ruzic-Muslic, D.; Salamon, D.; Simcic, M.; Stepanek, O.; Curik, I.; Cubric-Curik, V.; Lenstra, J. A. |